O estudante do ensino fundamental Akira Todo leva uma vida tranquila no norte de Okinawa ao lado de sua irmã mais velha, Haruka, e de sua mãe, que administra um café. No entanto, a família esconde um segredo: o poder “Engine” de Haruka, herdado de seu pai. Akira não recebeu a mesma habilidade e desenvolveu um complexo de inferioridade por precisar ser constantemente protegido pela irmã. Certo dia, acontecimentos estranhos começam a ocorrer em várias partes do mundo. Qual será o objetivo dos inimigos desconhecidos que se aproximam de Akira e das pessoas ao seu redor...?