Depois de uma experiência com o que parecia ser o fantasma de seu pai Patrick O'Hara, Scarlett e os Joes vão para sua cidade natal, Atlanta, Geórgia, onde ela visita a casa de sua família vazia. Ela aprende com as imagens recuperadas por Snake Eyes que seu pai inventou o Molecular Assembler Scrambler Sender (também conhecido como MASS Device) para a Cobra Industries usar para teletransportar tropas para a batalha. Enquanto isso, a Baronesa comanda os Bio-Vipers para atacar os Joes quando ela descobre que a pedra no medalhão de Scarlett desempenha um papel na trama do Comandante Cobra para usar o Dispositivo MASS. O motivo de Snake Eyes usar uma máscara também é revelado.