Edward tem a chance de criar a Pedra Filosofal com o aparato deixado no Quinto Laboratório, mas precisa levar em conta as consequências, pois Al está nas mãos deles. Ele descobre as armações em que os homúnculos estiveram envolvidos, como ele próprio estava sendo manipulado, e por que eles querem tanto a pedra filosofal. O exército também chega ao Quinto Laboratório.