"Não se deixe cegar pelo medo e pela raiva. Tudo é como é..." Um menino chamado Yoki, que consegue ver Mushi, foi encontrado na floresta por uma misteriosa senhora chamada Nui com apenas um olho. Acontece que Yoki estava viajando com sua mãe quando um deslizamento de terra esmagou sua mãe e ele ficou sozinho. A perna de Yoki mais tarde se cura sozinha, porém ele não parece ter para onde ir, então ele fica com o Nui e começa a aprender algumas coisas sobre o Mushi conhecido como "Tokoyami".