Archer escapa da estação e continua a tentar impedir os planos dos super-humanos. Entretanto o Dr. Soong descobre as verdadeiras intenções deles, que querem provocar uma guerra entre a Federação e os Klingons, enquanto constroem o seu império para aniquilar a humanidade. Com a ajuda de Soong, Archer consegue impedi-los. O Dr. Soong volta depois à prisão onde quer começar os seus estudos na criação de vida artificial.